Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms