Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms