Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Actn1Q7TPR4 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms