Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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