Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Platr22-201ENSMUST00000181274 1617 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm13576-201ENSMUST00000120851 778 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm7577-201ENSMUST00000182543 982 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm5696-201ENSMUST00000189850 552 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm6989-201ENSMUST00000218409 654 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc34Q3UI66 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc34Q3UI66 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms