Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms