Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Hoxd13P70217 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd13P70217 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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