Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxc11P31313 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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