Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PtprmP28828 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms