Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Hoxd10P28359 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Hoxd10P28359 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Hoxd10P28359 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Hoxd10P28359 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Hoxd10P28359 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Hoxd10P28359 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Hoxd10P28359 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Hoxd10P28359 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Hoxd10P28359 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd10P28359 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd10P28359 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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