Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Hoxd9P28357 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Hoxd9P28357 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Hoxd9P28357 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Hoxd9P28357 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Hoxd9P28357 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Hoxd9P28357 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Hoxd9P28357 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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