Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gjb1P28230 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Gjb1P28230 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gjb1P28230 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gjb1P28230 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gjb1P28230 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gjb1P28230 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gjb1P28230 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gjb1P28230 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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