Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PrkcaP20444 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms