Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Smim18J3QNP2 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms