Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

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Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc180J3QNE4 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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