Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Prrt4B2RU40 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms