Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
AgrnA2ASQ1 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms