Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a4Q9Z306 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc22a4Q9Z306 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc22a4Q9Z306 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc22a4Q9Z306 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc22a4Q9Z306 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc22a4Q9Z306 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc22a4Q9Z306 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms