Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hdac5Q9Z2V6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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