Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vamp5Q9Z2P8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms