Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms