Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NfkbiaQ9Z1E3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms