Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp2Q9Z0Z3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms