Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb6Q9Z0T9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms