Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn13Q9Z0S4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn13Q9Z0S4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn13Q9Z0S4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn13Q9Z0S4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn13Q9Z0S4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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