Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn1Q9Z0I7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms