Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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