Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms