Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcn5Q9WVD4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcn5Q9WVD4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms