Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slit3Q9WVB4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms