Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms