Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx1Q9WV80 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx1Q9WV80 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms