Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms