Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ramp3Q9WUP1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ramp3Q9WUP1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms