Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn8aQ9WTU3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn8aQ9WTU3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms