Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TapbpQ9R233 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms