Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcc6Q9R1S7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcc6Q9R1S7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcc6Q9R1S7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms