Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms