Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Taf7Q9R1C0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms