Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zeb2Q9R0G7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms