Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms