Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr54Q9R0D8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms