Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod2Q9R0B9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod2Q9R0B9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms