Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf346Q9R0B7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf346Q9R0B7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms