Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lamc3Q9R0B6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms