Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp11cQ9QZW0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp11cQ9QZW0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms