Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Npas3Q9QZQ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms