Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc39a1Q9QZ03 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc39a1Q9QZ03 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms