Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VapbQ9QY76 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VapbQ9QY76 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms