Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx8Q9QXV1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms